Upravni odbor Uprave za neizravno oporezivanje se sastoji od tri ministra financija, tri stručnjaka za neizravno oporezivanje, a ima promatrača iz Brčko Distrikta kao i promatrača iz Centralne Banke.
Članovi Upravnog odbora su:
| dr Nikola Špirić |
Ministar financija i trezora BiH i predsjedatelj UO |
| dr Zoran Tegeltija |
Ministar financija RS |
| Ante Krajina |
Ministar financija FBiH |
| Ismet Suljendić |
Ekspert Vijeća ministara BiH |
| Vladimir Trifković |
Ekspert iz RS |
| Šefika Hafizović |
Ekspert iz FBiH |
Promatrači:
| dr.sc. Miro Džakula |
Ravnatelj UNO |
| Mato Lučić |
Ravnatelj Direkcije za financije Brčko Distrikta |
| Amir Hadžiomeragić |
Promatrač ispred Centralne banke BiH |